珠三角地区医药流通体系发达，毗邻港澳地区，对外辐射能力较强，民营资本比较活跃，围绕广州、深圳等重点城市形成了商业网络发达的医药产业集群。国家统计局数据显示，2014年，珠三角地区医药制造企业达375家，占全国的比重为5.5%；实现主营业务收入1,290.4亿元，占全国的比重为5.5%；实现利润总额143.1亿元，占全国的比重为6.2%。

广州市创新驱动发展。目前，广州市医药产业集群已经形成了“两中心多区域”的布局，即以广州科学城为核心的产业孵化中心，以广州国际生物岛为核心的产业创新中心，以白云生物医药园区、番禺生物医药基地和从化生物医药基地等各区（县级市）特色产业园区为辐射区域的产业布局，拥有较完善的技术研发和中试、产品制造和技术服务的产业链。此外，广州市还拥有完整的医药产业产学研技术创新体系，形成了由10多所高等院校、40多家研究院所、70多个省级以上重点学科、5个国家重点实验室、7个国家工程技术研究中心（工程实验室）和400多家研发型企业组成的生物医药技术创新网络，工程化研究和产业化能力日益突出，是中国重要的医药创新源头之一。

深圳市研发体系发展较快。深圳市以创新药物研发和产业化、药品制剂出口和医药研发外包体系为核心的产业体系发展较快，技术研发优势突出：依托华大基因研究院组建了中国首个、全球第四个国家基因库，还建设了中国科学院生物医学信息与健康工程学重点实验室、北京大学深圳研究生院化学基因组学国家重点实验室等众多研发平台。随着生物医药产业被列为深圳市“十二五”重点发展的三大新兴产业之一，深圳作为我国南方医药产业核心城市的地位将进一步稳固。今后，深圳市有望成为我国医药制造业新的增长极。目前，深圳市医药研发水平与上海、北京两大研发中心差距较大，尤其是高端人才比较缺乏。但是，随着中国国家基因库的建立，深圳市生命科学研究及生物信息安全领域研发水平将得到极大地提高，并将成为中国基因技术、生命信息科学专项领域的研发中心。到“十二五”末期，深圳市将成为世界领先的基因治疗药物研发与产业化基地，亚洲最大的疫苗生产中心、中国领先的创新药物研发与产业化和药品制剂出口基地。